Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms