Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cavin1O54724 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms