Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms