Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casq1O09165 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casq1O09165 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms