Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22bO08547 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sec22bO08547 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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