Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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