Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms