Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21788J3QNH3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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