Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm21818J3KMS6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21818J3KMS6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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