Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms