Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4E9QAP7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms