Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms