Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r35E9Q7U8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms