Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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