Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FgaE9PV24 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms