Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2d4D3YUH6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms