Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syndig1A2ANU3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms