Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms