Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ino80eA0A0U1RP99 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ino80eA0A0U1RP99 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ino80eA0A0U1RP99 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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