Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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