Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trbv5A0A0B4J1G9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trbv5A0A0B4J1G9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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