Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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