Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms