Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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RTL8BQ17RB0 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
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RTL8BQ17RB0 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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RTL8BQ17RB0 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RTL8BQ17RB0 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
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RTL8BQ17RB0 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
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