Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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