Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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