Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP6AP1Q15904 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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