Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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