Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
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