Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CUL4BQ13620 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL4BQ13620 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms