Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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PEX6Q13608 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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PEX6Q13608 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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PEX6Q13608 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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PEX6Q13608 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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