Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCIRG1Q13488 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms