Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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ERCC8Q13216 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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ERCC8Q13216 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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ERCC8Q13216 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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ERCC8Q13216 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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ERCC8Q13216 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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