Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ACACAQ13085 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms