Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXO1Q12778 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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