Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms