Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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LRRTM2O43300 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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LRRTM2O43300 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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LRRTM2O43300 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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LRRTM2O43300 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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LRRTM2O43300 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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