Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EHD3Q9NZN3 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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