Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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