Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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ZBED3Q96IU2 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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ZBED3Q96IU2 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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ZBED3Q96IU2 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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