Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ZNF548Q8NEK5 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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