Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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