Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms