Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms