Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMC1AQ14683 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms