Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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PDE6HQ13956 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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PDE6HQ13956 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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