| RUNX3 | Q13761 | AC016550.2-202 | ENST00000511940 | 581 nt | TSL 2 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NARSP2-202 | ENST00000522022 | 349 nt | TSL 3 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003781.1-201 | ENST00000543403 | 404 nt | TSL 3 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF519P3-201 | ENST00000557158 | 1032 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC034268.2-201 | ENST00000571784 | 482 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091965.4-201 | ENST00000607691 | 587 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099654.13-201 | ENST00000639774 | 207 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PHF3-202 | ENST00000393387 | 6947 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EVI2B-202 | ENST00000577894 | 1597 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SENP7-205 | ENST00000394091 | 4434 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POSTN-209 | ENST00000541179 | 3214 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RBBP8-202 | ENST00000360790 | 2962 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAPK10-362 | ENST00000641864 | 4484 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-97P-201 | ENST00000363387 | 104 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-805P-201 | ENST00000365643 | 106 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EQTN-201 | ENST00000380031 | 725 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-348P-201 | ENST00000384386 | 107 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.559-201 | ENST00000384686 | 107 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR135A2-201 | ENST00000384854 | 100 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS20P2-201 | ENST00000402520 | 389 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356057.3-201 | ENST00000402607 | 340 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL138775.1-201 | ENST00000429539 | 575 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL596220.1-202 | ENST00000429768 | 314 nt | TSL 3 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | USP9YP14-201 | ENST00000430663 | 563 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL21P112-201 | ENST00000434403 | 463 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | UPP2-IT1-201 | ENST00000439185 | 357 nt | TSL 3 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL117336.1-201 | ENST00000439198 | 380 nt | TSL 2 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP1S3-208 | ENST00000446015 | 499 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS3P1-201 | ENST00000456781 | 192 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL21P41-201 | ENST00000459863 | 264 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010285.1-201 | ENST00000470580 | 392 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006483.1-201 | ENST00000487308 | 313 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBE2Q2P9-201 | ENST00000490086 | 202 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093278.1-201 | ENST00000494700 | 600 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTPRG-AS1-210 | ENST00000498655 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01846-201 | ENST00000505908 | 651 nt | TSL 5 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC109454.3-201 | ENST00000512748 | 669 nt | TSL 3 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND3P5-201 | ENST00000512798 | 333 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO2P32-201 | ENST00000514865 | 403 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP148-201 | ENST00000516527 | 94 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-528P-201 | ENST00000516926 | 100 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP002963.1-201 | ENST00000530590 | 184 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000873.5-201 | ENST00000533906 | 236 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DIAPH2-AS1-203 | ENST00000542084 | 450 nt | TSL 5 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091544.4-201 | ENST00000555268 | 342 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012213.3-201 | ENST00000577199 | 777 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008277.2-201 | ENST00000605196 | 797 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087752.4-201 | ENST00000605911 | 462 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL391813.2-201 | ENST00000609113 | 322 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010338.1-201 | ENST00000621823 | 717 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079597.1-201 | ENST00000624306 | 508 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPAM1-202 | ENST00000340011 | 2349 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND5P33-201 | ENST00000571250 | 1450 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYLC2-201 | ENST00000374798 | 2171 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM68-218 | ENST00000617782 | 2477 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ASNSP3-201 | ENST00000451989 | 1306 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WDFY3-AS2-202 | ENST00000451762 | 5814 nt | TSL 3 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MS4A5-201 | ENST00000300190 | 722 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA51.2-201 | ENST00000364595 | 132 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5H15-201 | ENST00000383696 | 930 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-533P-201 | ENST00000384144 | 107 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1119P-201 | ENST00000384349 | 108 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAJ32-201 | ENST00000390505 | 66 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC078974.1-201 | ENST00000411597 | 223 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006150.1-201 | ENST00000412014 | 263 nt | TSL 5 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDK8P2-201 | ENST00000415020 | 547 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | USP9YP13-201 | ENST00000417797 | 480 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01351-201 | ENST00000424735 | 526 nt | TSL 2 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MYL8P-204 | ENST00000431574 | 518 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00189-202 | ENST00000431661 | 308 nt | TSL 5 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092598.1-201 | ENST00000431708 | 797 nt | TSL 3 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL162734.1-201 | ENST00000432858 | 157 nt | TSL 5 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGN2P20-201 | ENST00000437531 | 273 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC125238.1-201 | ENST00000448842 | 249 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590365.1-201 | ENST00000450788 | 243 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP269-201 | ENST00000459032 | 137 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091179.1-201 | ENST00000461606 | 579 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104304.1-201 | ENST00000505797 | 291 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104663.1-201 | ENST00000508555 | 557 nt | TSL 2 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4LP18-201 | ENST00000526864 | 291 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003122.4-201 | ENST00000530980 | 758 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RGS4-209 | ENST00000531057 | 544 nt | TSL 4 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC103798.1-201 | ENST00000532562 | 376 nt | TSL 2 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022880.1-201 | ENST00000534017 | 973 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HOMER1-205 | ENST00000535690 | 642 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC055720.1-201 | ENST00000539552 | 475 nt | TSL 5 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010183.2-202 | ENST00000546791 | 382 nt | TSL 3 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SYF2P1-201 | ENST00000550658 | 413 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4K8P-201 | ENST00000578842 | 1048 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01900-203 | ENST00000585185 | 393 nt | TSL 3 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL031176.1-201 | ENST00000604554 | 466 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098614.4-201 | ENST00000607601 | 462 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097717.1-249 | ENST00000608040 | 401 nt | TSL 5 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108747.1-201 | ENST00000609508 | 535 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006023.2-201 | ENST00000609916 | 167 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL591441.2-201 | ENST00000620059 | 535 nt | TSL 5 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012150.2-201 | ENST00000621300 | 544 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007405.1-203 | ENST00000623667 | 932 nt | TSL 5 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDK1-202 | ENST00000373809 | 1613 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |