Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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