Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms