Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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