Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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